バイオメタンは、バイオLNGとも呼ばれ、ほとんどメタンベースのガスである。有機物を分解することで生成される。微生物を使って、作物残渣、家畜ふん尿、生ごみ、廃水汚泥などの作物や廃棄物を分解する。このプロセスによってバイオガスが生成され、バイオメタンに改良される。バイオガス改良の主な副産物はCO2.

バイオメタンは持続可能な原料が限られているため、希少な資源である。しかし、海運セクターはバイオメタンを燃料の選択肢の一つとして検討している。農場から船上での燃焼に至るまで、バイオメタンのサプライチェーンによる予期せぬノックオン効果やロックイン効果を避けるためには、さらなる効率化と需要削減対策が必要である。以下は、バイオメタンが現在のところ 現状では船舶の脱炭素化のための短期、中期、長期の解決策ではない3つの理由：

1. メタンの漏れ バイオメタンのサプライチェーンからは、CO2の80倍もの温室効果ガス（GHG）であり、今日の地球温暖化の約3分の1を占める強力な温室効果ガスであるメタンが漏れている。バイオガスのライフサイクルにおける現在のメタン漏れ率は、生産されるガスの単位あたり化石ガスよりも多くの温室効果ガスを排出する可能性がある。また、バイオメタン生産とサプライチェーンからのメタン排出量は、推定量の2倍以上になる可能性もある。さらに、バイオメタンをガスグリッドに注入する際には、化石ガスシステムと船舶エンジンからのメタン漏れを考慮しなければならない。妥当な漏出量と需要の仮定の下では、バイオメタンは気候集約的である。
2. バイオメタン原料構成における、目的に応じて栽培されたエネルギー作物の誤解を招く予測。 ガス業界による糞尿と農業残渣の予測量は、特に明確に禁止されていない一次エネルギー作物の使用について懸念を抱かせる。バイオメタン原料構成に目的別に栽培されたエネルギー作物を含めることに反対する関係者のコンセンサスにもかかわらず、2020年にEUで生産されるバイオガスの40％以上を占めている。欧州は、世界的に見てもバイオメタン生産量のトップである。さらに、主要バイオガス生産者によるバイオメタン原料の国別予測には、エネルギー作物が引き続き含まれており、他のいくつかの国では、エネルギー作物用の土地利用が増加している。第二世代バイオメタンを使用する場合でも、廃棄物は他のバイオマスの流れから採取され、それらは肥料や家畜の飼料として使用されてきた可能性があり、畑作物に取って代わられる可能性がある。ほとんどすべてのバイオ燃料が、間接的に土地利用の変化を引き起こしているという証拠がある。さらに、使用されるバイオマスの廃棄状況に関して、不正が広く行われていることが示唆されている。
3. 無駄の削減は最も効果的な対策である。システム的な観点から見ると、どのような由来の廃棄物であれ、それが貴重な資源になると、逆インセンティブが働く。その結果、廃棄物は副産物としてではなく、むしろ副産物として生産されるようになり、廃棄物防止の努力を損なうことになる。例えば、糞尿をバイオメタン原料として使用する場合、経済的に成立させるためには大規模な生産が必要だが、畜産による気候への影響全体はわずかしか削減できない。気候危機に対処するためには、畜産を減らす必要がある。さらに バイオメタンの拡大は、2030年までに食品廃棄物を50％削減するという持続可能な開発目標などの取り組みを台無しにし、土地ベースの全体的な緩和策と人間の健康目標を損なう。 バイオメタン産業は、危険な規模で集約的な畜産を固定化することになる。

船舶の脱炭素化のためのバイオメタン利用可能量は、業界の予想よりも大幅に低い可能性がある。バイオメタンの持続可能性と実現可能性を評価するためには、フードシステムの視点、システミック・インパクト・レビュー、メタン漏れに対するライフサイクル・アプローチ、学際的アプローチなど、より広範なエビデンスと専門知識が必要である。それまでは、バイオメタンは海運の脱炭素化の解決策にはならない。